|
課程名稱 |
生物資訊導論
Introduction to Bioinformatics |
|
開課學期 |
104-2 |
|
授課對象 |
電機資訊學院 生醫電子與資訊學研究所 |
|
授課教師 |
曾宇鳳 |
|
課號 |
md&ph5070 |
|
課程識別碼 |
420 U3010 |
|
班次 |
|
|
學分 |
1 |
|
全/半年 |
半年 |
|
必/選修 |
選修 |
|
上課時間 |
星期三6(13:20~14:10) |
|
上課地點 |
基醫509 |
|
備註 |
本課程中文授課,使用英文教科書。醫學校區研究所共同課程。生物資訊導論僅為生物資訊學之第1小時課程主題講解。與林榮信、陳倩瑜、蔡孟勳、歐陽彥正合開
總人數上限：60人 |
|
Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/1042md_ph5070_ |
|
課程簡介影片 |
|
|
核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
|
課程大綱
|
|
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
|
|
課程概述 |
本課程將討論生物資訊學基本原理及實際應用，以使修習同學能充分掌握如何運用電腦的處理能力，有效解決生醫研究上資料分析，生物醫學資料庫應用分析，以及生物分子結構分析與功能預測。本課程生物資訊導論(課號：MD&PH5028，課程識別碼：420 U3010，1學分)僅為生物資訊學(課號:CSIE5036、課程識別碼：922 U0370，3學分)之第一小時課程主題講解部份，並不包含該課程後二小時電腦軟體及資料庫的使用實習。如需參與電腦上機實習，請改修習生物資訊學。
|
|
課程目標 |
本課程將討論生物資訊學基本原理及實際應用，以使修習同學能充分掌握如何運用電腦的處理能力，有效解決生醫研究上資料分析，生物醫學資料庫應用分析，以及生物分子結構分析與功能預測。本課程生物資訊導論(課號：MD&PH5028，課程識別碼：420 U3010，1學分)僅為生物資訊學(課號:CSIE5036、課程識別碼：922 U0370，3學分)之第一小時課程主題講解部份，並不包含該課程後二小時電腦軟體及資料庫的使用實習。如需參與電腦上機實習，請改修習生物資訊學。
|
|
課程要求 |
待補 |
|
預期每週課後學習時數 |
|
|
Office Hours |
|
|
指定閱讀 |
待補 |
|
參考書目 |
1. Introduction to Bioinformatics," Arthur M. Lesk, Oxford, 2002
2. Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis," David W. Mount, 2nd Edition, Cold Spring Harbor Lab. Press
3. Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins, Andreas D. Baxevanis, B. F. Francis Ouellette, Wuket Kussm, 3rd Edition
|
|
評量方式
(僅供參考) |
|
|
週次 |
日期 |
單元主題 |
|
第1週 |
02/24 |
Introduction of bioinformatics (曾宇鳳 老師) |
|
第2週 |
03/02 |
Sequence analysis 1 (陳倩瑜 老師) |
|
第3週 |
03/09 |
Sequence analysis 2 (陳倩瑜 老師) |
|
第4週 |
03/16 |
Gene expression 1 (蔡孟勳 老師) |
|
第5週 |
03/23 |
Gene expression 2 (蔡孟勳 老師) |
|
第6週 |
03/30 |
Gene expression 3 (蔡孟勳 老師) |
|
第7週 |
04/06 |
Genome analysis (SNP) (蔡孟勳 老師) |
|
第8週 |
04/13 |
Midterm 1 (地點: 102 講堂) |
|
第9週 |
04/20 |
Phylogentics analysis (曾宇鳳 老師) |
|
第10週 |
04/27 |
Genome analysis (蔡孟勳 老師) |
|
第11週 |
05/04 |
Data mining 1 (歐陽彥正 老師) |
|
第12週 |
05/11 |
Data mining 2 (歐陽彥正 老師) |
|
第13週 |
05/18 |
Midterm 2 (地點: 102 講堂) |
|
第14週 |
05/25 |
Structural classification of proteins (林榮信 老師) |
|
第15週 |
06/01 |
Structural bioinformatics (林榮信 老師) |
|
第16週 |
06/08 |
Bioinformatics database (曾宇鳳 老師) |
|
第17週 |
06/15 |
Bioinformatics database (曾宇鳳 老師) |
|
第18週 |
06/22 |
Final exam (地點: 102 講堂) |
|